يكلف أحد أعضاء هيئة التدريس الليبيين مديراً للمركز، بقرار من رئيس الجامعة لمدة أربع سنوات قابلة للتجديد، ويعامل إداريا وماليا معاملة عمداء كليات الجامعة، وفق اللوائح والتشريعات السارية بالخصوص.
يتولى مدير المركز إدارة شؤون المركز وإصدار التعليمات اللازمة، ويعد مسؤلا عن سياسات المركز وتنفيذ قرارات مجلس إدارته ويؤدي المهام التالية :
- يقوم بترشيح أعضاء مجلس إدارة المركز؛ من هيئة التدريس والمستشارين، وفقا لتخصصاتهم وخبراتهم.
- إدارة شؤون المركز الوظيفية والبحثية وفقا للقوانين واللوائح والنظم المعمول بها، والقرارات الصادرة من إدارة المركز.
- الإشراف على تنظيم الدورات والمؤتمرات العلمية والأنشطة دات العلاقة بالمركز.
- تمثيل الجامعة والمركز في علاقته مع المؤسسات والمراكز ذات العلاقة .
- التواصل مع مؤسسات المجتمع المدني.
- الإشراف و متابعة الأقسام والإدارات التابعة للمركز.
- الإشراف علي إعداد الحسابات الختامية للمركز.
- اقتراح صرف الأجور و الحوافز و المكافاءات للعاملين والمتعاونين بالمركز.
- إعداد التقارير الدورية عن سير العمل و عرضه علي مجلس الإدارة.
- اعتماد صرف مستندات الصرف.
- ما يفوضه به مجلس الإدارة.