•   عضو في الفريق البحثي التابع لمؤسسة JTI السويدية لدراسة الغازات الحيوية المنبعثة من الترب الزراعية المسمدة بالأسمدة العضوية المختلفة ومدي تأثيرها على البيئة (2008-2011).
•   عضو في الفريق البحثي التابع لـ MicroDrive المختص بدراسة وتقييم فاعلية استخدام المخلفات العضوية (المتبقية من إنتاج الغاز الحيوي) في تسميد الترب الزراعية (2008-2011).
•  رئيس قسم الاتجاه العام في كلية الزراعة – جامعة سبها -ليبيا (2014-2017 ).
•   عضو في لجنة الدراسات العليا بقسم التربة والمياه -كلية الزراعة – جامعة سبها -ليبيا (2017 -2018).
•    رئيس اللجنة العلمية لجائزة جامعة سبها للتميز في البحث العلمي في اطلالتها الاولى والتانية والثالثة.
•  رئيس لجنة متابعة التصنيفات العالمية واستيفاء متطلباتها للجامعة.
•    رئيس لجنة منح الموافقة الاخلاقية للبحث العلمي.
•    رئاسة العديد من اللجان المشكلة بقرار من رئيس الجامعة لإنجاز مهام علمية وإدارية.
•  مدير مركز البحوث والاستشارات العلمية بجامعة سبها حاليا.

الأشراف علي جزاء من البحوث الخاصة بطلبة البكالوريوس في الجامعة السويدية (2010-2011).

المشاركة في المؤتمر العلمي بالدنمارك (Conference Beyond Kyoto) (2009).

المشاركة في ورشة عمل بعنوان Focus on soils snd water, مكان الانعقاد جامعة SLU السويدية (03-03-2011).

عضو هيئة تدريس في جامعة سبها / ليبيا – كلية الزراعة – قسم التربة والمياه (2013 - 2018).

الأشراف على البحوث اللازمة للحصول على درجة البكالوريوس في جامعة سبها – كلية الزراعة – ليبيا (2014-الي الان).

الأشراف على البحوث اللازمة للحصول على درجة الماجستير في جامعة سبها – كلية العلوم وكلية الزراعة – ليبيا (2020-الي الان).

مقيم بحوث في المجلات العلمية التالية:

  African Journal of Agricultural Research (ISSN: 1991-637X)

  African Journal of Biotechnology (ISSN: 1684-5315)

  Applied Soil Ecology (ISSN: 0929-1393)

  Archives of Agronomy and Soil Science (ISSN: 03650340)

  European Journal of Soil Science (ISSN:1365-2389)

  Journal of Soil Science and Plant Nutrition (ISSN: 0718-9516)

  Journal of Soils and Sediments (ISSN: 1614-7480)

  Peer J (ISSN: 21678359)

  Scientific African (ISSN: 2468-2276)

Soil Science Society of America Journal (ISSN:1435-0661)

Waste Management (ISSN: 0956-053X)

International journal of recycling organic waste in agriculture (ISSN: 2195-3228)

Hindawi – Journal of Nanomaterials (ISSN: 1687-4129)

Journal of Agriculture and Food Research (ISSN: 2666-1543)

Scientific Reports (ISSN: 2045-2322)

Soil and Tillage Research (ISSN: 0167-1987)

1. Odlare, M., Arthurson, V., Pell, M., Svensson, K., Nehrenheim, E. & Abubaker, J. 2011. Land application of organic waste - Effects on the soil ecosystem. Applied Energy, 88, 2210-2218.
2.  Abubaker, J. 2012. Effects of fertilization with biogas residues on crop yield, soil microbiology and greenhouse gas emissions. Doctoral thesis, Acta Universitatis Agriculturae Sueciae .p 79.
3.  Abubaker, J., Risberg, K. & Pell, M. 2012. Biogas residues as fertilizers - effects on wheat growth and soil microbial activities. Applied Energy, 99, 126-134.
4.  Odlare, M., Abubaker, J., Lindmark, J., Pell, M., Thorin, E. &Nehrenheim, E. 2012. Emissions of N2O and CH4 from agricultural soils amended with two types of biogas residues. Biomass and Bioenergy, 44, 112-116.
5.  Rodhe, L., Abubaker, J., Ascue, J., Nordberg, A. & Pell, M. 2012. Greenhouse gas emissions from pig slurry during storage and after field application in northern European conditions. Biosystems Engineering, 113, 379-394.
6.  Abubaker, J., Cederlund, H., Pell, M. & Arthurson, V. 2013. Bacterial community structures and microbial activities of different soils amended with biogas residues and cattle slurry. Applied Soil Ecology, 72, 171-180.
7.  Abubaker, J., Odlare, M. & Pell, M. 2013. Nitrous Oxide Production from Soils Amended with Biogas Residues and Cattle Slurry. Journal of Environmental Quality, 42, 1046-1058.
8.  Odlare, M., Pell, M., Arthurson, V., Abubaker, J. & Nehrenheim, E. 2014. Combined mineral N and organic waste fertilization - effects on crop growth and soil properties. Journal of Agricultural Science, 152, 134–145.
9.  Abubaker, J., Risberg, K., Jönsson, E., Pell, M., Dahlin, S. & Cederlund, H. 2015. Short-term effects of biogas residue and pig slurry application on soil microbial activity. Applied and Environmental Soil Science, 2015, 15.
10.  Elnesairy, N.N.B., Abubaker, J., Mahmod, H., Mukhtar, N. 2016. The impact of Bradyrhizobium, farmyard manure and inorganic nitrogen on growth and yield of guar. World Journal of Agricultural Research, 4, 56-63.
11.  Abubaker, J., Elnesairy, N., Ahmed, S. 2017. Effects of non-digested and anaerobically digested farmyard manures on wheat crop cultivated in desert soil. Journal of Aridland Agriculture, 3, 1-10.
12. El-Zeadani, H., Abubaker, J., Essalem, M., Alghali., A. 2018. Germination of several wheat cultivars in desert soil after amendment with raw and digested poultry manure with and without combination with mineral fertilizer. International Journal of Recycling of Organic Waste in Agriculture, 7:335-343.
13.  Abubaker, J., Ibrahim, N., Alkanami, M., Alaswd, A., El-Zeadani, H. 2020. Response of winter wheat to the application rate of raw and digested sheep manure alone and supplemented with urea in Libyan desert soil. Scientific African, 8: e00332.
14. Abubaker, J., Essalem, M., El-Zeadani, H., Alghali, A. 2020. Effect of time interval between sowing and application of nondigested/digested cattle manure on germination of several wheat cultivars and seedling growth in desert soil. Agriculture research and technology, 24: 81-90.
15. Abubaker, J., Alaswd, A., Mohammed, N., El‑Zeadani, H., Khalifa, M. 2022. Alfalfa (Medicago sativa L.) growth and yield in desert soil fertilized with raw and anaerobically digested cattle manure. Journal of Plant Nutrition, 45 (7): 992-1003.
16. Jamal Abubaker, Nouriya Salah Mohammed, Mohemed Essalem, Abdelsalam Abobaker, Massoudah Khalifa. 2022. Effect of seed inoculation method with Rhizobium on the germination of alfalfa seeds (Medicago sativa L.).Journal of Pure & Applied Sciences, 21 (2), 135 - 140.